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杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

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编号 zgly0001414349

文献类型 期刊论文

文献题名 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

作者 彭沙沙  童再康  黄华宏  周厚君  时剑  林二培 

作者单位 浙江农林大学林业与生物技术学院 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S791.27 

关键词 林木育种学  杉木  纤维素合成酶类似蛋白  克隆  表达 

文摘内容 纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。

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