编号
zgly0000564117
文献类型
期刊论文
文献题名
按蚊防御素基因家族转录模式和启动子的生物信息学分析
学科分类
220.3020;森林昆虫学
作者单位
贵阳医学院医学生物技术教研室
贵阳医学院寄生虫学教研室
母体文献
生物信息学
年卷期
2008,6(3)
页码
109-112
年份
2008
分类号
Q969.92
关键词
防御素
冈比亚按蚊
转录模式
转录因子
文摘内容
运用生物信息学方法分析冈比亚按(Anopheles gambiae)中防御素基因家族的表达模式和启动子保守区。在ENSEMBL数据库中搜索防御素基因家族序列,然后将基因编号输入angaGEDUCI数据库中进行分析。结果在冈比亚按蚊中存在有4个防御素基因的异构体分子,其中DEF1基因表达模式与其它3个基因存在明显差异。4个防御素基因启动子序列都存在AP-1、GATA-1、GCN4、GR、HNF-3B、TFIID6个转录因子的识别结合位点,表明这6个转录因子是冈比亚按蚊防御素基因家族表达调控所必需的。值得注意的是,DEF1基因启动子序列中存在与性别决定翦关的SOXproteins转录因子的结合位点,暗示DEF1基因的转录调控可能与性别分化有关;而在DEF2基因启动子序列中存在有热激因子(HSTF)的识别结合位点,表明热刺激会调控DEF2基因的表达。