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按蚊防御素基因家族转录模式和启动子的生物信息学分析

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编号 zgly0000564117

文献类型 期刊论文

文献题名 按蚊防御素基因家族转录模式和启动子的生物信息学分析

学科分类 220.3020;森林昆虫学

作者 刘红美  吴建伟 

作者单位 贵阳医学院医学生物技术教研室  贵阳医学院寄生虫学教研室 

母体文献 生物信息学 

年卷期 2008,6(3)

页码 109-112

年份 2008 

分类号 Q969.92 

关键词 防御素  冈比亚按蚊  转录模式  转录因子 

文摘内容 运用生物信息学方法分析冈比亚按(Anopheles gambiae)中防御素基因家族的表达模式和启动子保守区。在ENSEMBL数据库中搜索防御素基因家族序列,然后将基因编号输入angaGEDUCI数据库中进行分析。结果在冈比亚按蚊中存在有4个防御素基因的异构体分子,其中DEF1基因表达模式与其它3个基因存在明显差异。4个防御素基因启动子序列都存在AP-1、GATA-1、GCN4、GR、HNF-3B、TFIID6个转录因子的识别结合位点,表明这6个转录因子是冈比亚按蚊防御素基因家族表达调控所必需的。值得注意的是,DEF1基因启动子序列中存在与性别决定翦关的SOXproteins转录因子的结合位点,暗示DEF1基因的转录调控可能与性别分化有关;而在DEF2基因启动子序列中存在有热激因子(HSTF)的识别结合位点,表明热刺激会调控DEF2基因的表达。

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