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喜树中ABA转运蛋白基因CaABAT的克隆及生物信息学分析

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编号 zgly0001577025

文献类型 期刊论文

文献题名 喜树中ABA转运蛋白基因CaABAT的克隆及生物信息学分析

作者 王燕燕  洪雨晨  韩玉乾  于放 

作者单位 大连工业大学生物工程学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年02期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S792.99 

关键词 喜树  脱落酸  脱落酸转运蛋白  重组质粒  生物信息学 

文摘内容 以喜树叶片提取的总RNA为模板,通过RT-PCR方法扩增喜树中的ABA转运蛋白基因CaABAT全长序列,并克隆到pGMT载体中,序列分析表明,CaABAT基因4 377 bp,编码1 458个氨基酸,等电点为7.82,分子量约为164.8 KD,且该基因与拟南芥中ABA转运蛋白基因At ABCG40氨基酸序列同源性高达73%,并将该序列提交至GenBank(No.KY882555)。该蛋白的二级结构中α-螺旋为49.45%,β-折叠为11.04%,无规则卷曲39.51%,定位细胞的质膜上。且该蛋白基因功能分类体系(Gene ontology)分析显示其具有ATPase依赖的跨膜转运活性,可能参与细胞内如含氮化合物代谢过程。然后分别分段导入至酵母表达载体pDRGAL与植物表达载体pBIGD中,构建重组质粒pDRGAL-CaABAT和pBIGD-CaABAT。最终为探究CaABAT转运ABA功能以及研究其对植物次生代谢调控奠定基础。

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