编号 zgly0001648639

文献类型 期刊论文

文献题名 白及丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)基因的序列分析

作者 沈访  李林  潘胤池  张社波  马激  徐德林 

作者单位 遵义医学院附属医院  遵义医学院细胞生物学教研室 

母体文献 植物研究 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S567.239 

关键词 白及  丝氨酸羟甲基转移酶  序列分析  结构预测 

文摘内容 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞光合作用和一碳代谢的关键酶之一,研究SHMT基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义。从白及转录组数据库中分离得到SHMT基因(NCBI登录号:MG544187),运用生物信息学软件对该基因进行序列分析。结果显示:该基因长度为1 953 bp,编码的蛋白质长度为471aa、分子量为51.861 06 k D、理论等电点为7.17,SHMT二级结构主要由无规则卷曲结构和α螺旋结构组成,核苷酸和氨基酸序列与铁皮石斛SHMT相似性最高,达93%,结构域分析发现该蛋白具有高度保守结构域,三级结构预测为四聚体结构,跨膜区及信号肽分析发现该蛋白无跨膜区及信号肽,亚细胞定位分析发现该蛋白主要位于细胞质、叶绿体亚细胞器位置。本分析结果为白及SHMT的应用研究提供了基础数据,也为植物SHMT基因的分子研究提供了理论依据及基础资料。