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菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析

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编号 zgly0001722907

文献类型 期刊论文

文献题名 菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析

作者 阮城城  胡福初  罗志文  王祥和  郭利军  李玉静  范鸿雁  韩冰  陈哲  张治礼 

作者单位 海南省农业科学院热带果树研究所·海南省热带果树生物学重点实验室·农业部??谌却骺蒲Ч鄄馐笛檎?ensp; 海南大学热带作物学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2020年11期

年份 2020 

分类号 S668.3 

关键词 菠萝  TCP基因  基因家族  表达分析 

文摘内容 【目的】筛选并分析菠萝TCP(Teosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利诱花过程中的功能研究提供参考?!痉椒ā恳浴ㄅ?6号’菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRTPCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况?!窘峁抗布ǔ?个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族。菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复制和串联复制事件。启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2、AcTCP5~AcTCP9均含有乙烯响应元件。表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍。【结论】鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现AcTCP1、AcTCP3、AcTCP7和AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关。

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