编号 zgly0001660309

文献类型 期刊论文

文献题名 基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析

作者 郭燕  乔大河  杨春  李燕  陈正武  陈娟 

作者单位 贵州省农业科学院茶叶研究所 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 S571.1 

关键词 古茶树  SNP  遗传结构  进化关系 

文摘内容 贵州久安分布着大量的古茶树资源。为了明晰这些茶树资源间的遗传关系,本研究以分布于久安5个不同区域的100份古茶树为材料,首先利用GBS(genotyping by sequencing)技术对它们的全基因组SNP进行了鉴定,然后基于鉴定到的SNP进行了系统进化树构建、主成分分析以及遗传结构分析。100份古茶树材料共获得548597个高质量SNP,并对这些SNP进行了变异类型注释。系统进化树、主成分分析以及遗传结构分析的结果高度一致,结果表明同一区域内的材料间亲缘关系较近;100份资源可以分为3个类群;古茶园(G)的材料与其他4个区域的材料遗传背景差异较大,这4个区域的资源可能有相同的亲本来源。