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数据资源: 中文期刊论文

双翅目昆虫线粒体基因组结构特点及其测序通用引物的设计和应用

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编号 zgly0001447538

文献类型 期刊论文

文献题名 双翅目昆虫线粒体基因组结构特点及其测序通用引物的设计和应用

作者 张乃心  张玉娟  余果  陈斌 

作者单位 重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所  重庆市动物生物学重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2013年04期

年份 2013 

分类号 Q963 

关键词 双翅目  葱蝇  线粒体基因组  基因结构  保守区域  通用引物 

文摘内容 研究双翅目昆虫线粒体基因组的结构特点,并设计其测序的通用引物,为今后双翅目昆虫线粒体基因组的研究提供参考和依据。利用比较基因组学和生物信息学方法,分析了已经完全测序的26个双翅目昆虫线粒体基因组的结构特点、碱基组成和保守区,并据此设计了双翅目昆虫基因组测序的通用引物。结果表明:双翅目昆虫线粒体基因组长14503~19517bp,其结构保守,含有37个编码基因,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA编码基因和2个rRNA编码基因,此外还包含一段长度差异很大的非编码区(AT富含区)?;蜃槟诨蚺帕写涡蛭榷?除个别基因外,其余都与黑腹果蝇Drosophila melanogaster基因排列次序一致。基因组的碱基组成不均衡,AT含量在72.59%~85.15%之间,碱基使用存在偏向性,偏好使用AC碱基。全基因组的核苷酸和氨基酸序列保守,共鉴定了11个保守区。在保守区内共设计了26对双翅目线粒体基因组测序通用引物,扩增的目标片段都在1200bp以内。将该套通用引物用于葱蝇Delia antiqua线粒体全基因组测序,结果证明其高效、合用。

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