编号 zgly0001495760

文献类型 期刊论文

文献题名 大垫尖翅蝗转录组分析

作者 金永玲  丛斌  王丽艳  张海燕  董辉 

作者单位 沈阳农业大学植物?；ぱг?ensp; 黑龙江八一农垦大学农学院 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2015年08期

年份 2015 

分类号 S812.6 

关键词 大垫尖翅蝗  转录组  基因注释  GO数据库  COG数据库  KEGG数据库  简单重复序列 

文摘内容 【目的】大垫尖翅蝗Epacromius coerulipes(Ivanov)是广泛分布的草原蝗虫之一,但其基因资源缺乏。为了获得大垫尖翅蝗的基因数据,对其进行了转录组测序和分析?！痉椒ā坷肐llumina公司paired-end转录组的测序技术进行从头组装?！窘峁孔芗苹竦昧?3 033条unigenes,平均长度为772 bp,N50为1 589 bp。通过BLAST搜索,确定有25 132条(39.87%)unigenes与NCBI数据库已知的蛋白质相匹配,其中有24 841,16 490,11 558和8 013条unigenes成功注释到Nr,Swiss-Prot,GO和COG数据库中。KEGG数据库中,7 218条unigenes形成218条代谢或信息通路。其中,189条unigenes参与外源性物质或药物的代谢通路。进一步分析显示,213条unigenes被确认为可能参与外源性物质的解毒作用,29条unigenes被确定为编码杀虫剂的目标蛋白。此外,检测到5 696条简单重复序列?！窘崧邸扛米甲椴庑蚍治鼋徊窖芯看蟮婕獬峄鹊幕蚬δ芊治黾吧背婕恋目挂┬曰品治龅於ǚ肿踊　?/em>