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中国野葡萄锌指蛋白基因的克隆及生物信息学分析

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编号 zgly0001376422

文献类型 期刊论文

文献题名 中国野葡萄锌指蛋白基因的克隆及生物信息学分析

作者 文志丰  赵素平  王西平  王倩 

作者单位 西北农林科技大学园艺学院  农业部西北园艺植物种质资源应用重点开放实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2010年10期

年份 2010 

分类号 S663.1 

关键词 中国野葡萄  白粉病  锌指蛋白  转录因子  RACE  生物信息学 

文摘内容 【目的】在受白粉病菌侵染的中国野葡萄叶片中克隆锌指蛋白基因全长,研究葡萄抗白粉病的分子机制?!痉椒ā吭谇捌诓捎胢RNA差异显示技术获得的中国野葡萄华东葡萄株系白河35-1抗白粉病基因表达差异cDNA片段T11GG/B0324-292的基础上,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了该cDNA全长序列,并结合生物信息学方法对所获取的序列进行分析?!窘峁扛胏DNA全长2663bp(GenBank登录号HM008621),具有完整的开放阅读框,基因全长2223bp,编码1个由740个氨基酸组成的锌指蛋白(Zinc finger protein),5′和3′非翻译区长度分别为395和44bp。多重比较分析表明,该基因推导的氨基酸序列与拟南芥、蒺藜苜蓿、水稻的C3H亚型CCCH型锌指蛋白的同源性分别为61%,70%和60%?!窘崧邸坷肦ACE技术获得了锌指蛋白基因全长,为进一步研究锌指蛋白基因与葡萄抗白粉病的关系奠定了基础。

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