编号
zgly0001710196
文献类型
期刊论文
文献题名
草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析
作者
廖永林
李燕芳
杨斌
赵华
高燕
陈伟平
蔡时可
王继华
作者单位
广东省农业科学院植物?;ぱ芯克愣≈参锉;ば录际踔氐闶笛槭?ensp;
中国农业科学院植物?;ぱ芯克?ensp;
广东省农业技术推广总站
广东省农业科学院作物研究所广东省农作物遗传改良重点实验室
母体文献
昆虫学报
年卷期
2020年05期
年份
2020
分类号
S433.4
关键词
草地贪夜蛾
发育阶段
嗅觉基因
转录组
基因注释
生物信息学
文摘内容
【目的】草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫。本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析?!痉椒ā坷酶咄坎庑蚣际醵圆莸靥耙苟晷坌猿沙婧?龄幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析。【结果】经de novo组装共获得209 002条转录本,平均长度为687.55 bp,N50为982 bp。共有46 198条(57.43%) unigene在至少一个数据库中获得功能注释,其中1 713条(2.13%) unigene在所有数据库中均能获得注释。在GO数据库中获得205 269条unigene的注释,主要包括68个功能分类;在KEGG数据库中共有3 408条unigene得到注释,涉及277个代谢通路。共鉴定到424个嗅觉相关的基因,并且在雄性成虫和5龄幼虫之间的表达存在差异。通过比较转录组分析,在雄性成虫中鉴定到9 162个上调和6 399个下调差异表达基因(DEGs);功能富集分析发现在上调DEGs中涉及信息素以及信号转导的代谢通路显著富集,而下调DEGs中涉及解毒相关的通路显著富集。【结论】这些转录组数据为探究草地贪夜蛾的生长发育、嗅觉相关功能基因以及候选分子靶标提供资源信息。