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数据资源: 中文期刊论文

草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析

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编号 zgly0001710196

文献类型 期刊论文

文献题名 草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析

作者 廖永林  李燕芳  杨斌  赵华  高燕  陈伟平  蔡时可  王继华 

作者单位 广东省农业科学院植物?;ぱ芯克愣≈参锉;ば录际踔氐闶笛槭?ensp; 中国农业科学院植物?;ぱ芯克?ensp; 广东省农业技术推广总站  广东省农业科学院作物研究所广东省农作物遗传改良重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S433.4 

关键词 草地贪夜蛾  发育阶段  嗅觉基因  转录组  基因注释  生物信息学 

文摘内容 【目的】草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫。本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析?!痉椒ā坷酶咄坎庑蚣际醵圆莸靥耙苟晷坌猿沙婧?龄幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析。【结果】经de novo组装共获得209 002条转录本,平均长度为687.55 bp,N50为982 bp。共有46 198条(57.43%) unigene在至少一个数据库中获得功能注释,其中1 713条(2.13%) unigene在所有数据库中均能获得注释。在GO数据库中获得205 269条unigene的注释,主要包括68个功能分类;在KEGG数据库中共有3 408条unigene得到注释,涉及277个代谢通路。共鉴定到424个嗅觉相关的基因,并且在雄性成虫和5龄幼虫之间的表达存在差异。通过比较转录组分析,在雄性成虫中鉴定到9 162个上调和6 399个下调差异表达基因(DEGs);功能富集分析发现在上调DEGs中涉及信息素以及信号转导的代谢通路显著富集,而下调DEGs中涉及解毒相关的通路显著富集。【结论】这些转录组数据为探究草地贪夜蛾的生长发育、嗅觉相关功能基因以及候选分子靶标提供资源信息。

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