编号 zgly0001436650

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲MEP途径系列基因5′端非编码区的顺式作用元件预测

作者 乌云塔娜  刘慧敏  杜红岩 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心  国家林业局杜仲工程技术研究中心  中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  中南林业科技大学林学院 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2013年04期

年份 2013 

分类号 S567.19 

关键词 杜仲  MEP途径  5′端非编码区  顺式作用元件 

文摘内容 为深入了解杜仲MEP途径基因5′端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5′端非编码区顺式作用元件的结构和功能。生物信息学分析表明:EuDXS2基因5′端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA-box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5′端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATAbox和32个CAAT-box;EuCMK基因5′端非编码区预测出24种共134个顺式作用元件,包含32个CAAT-box和68个TATA-box;EuMDS基因5′端非编码区共预测出30种共104个顺式作用元件,其中43个CAAT-box和23个TATA-box;EuHDS基因5′端非编码区预测出35种共126个顺式作用元件,包括29个CAAT-box和34个TATA-box;EuHDR基因5′端非编码区预测出24种共115个顺式作用元件,包含19个CAAT-box和67个TATA-box。