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毛果杨全基因组铵转运蛋白家族成员及其序列分析

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编号 zgly0000763597

文献类型 期刊论文

文献题名 毛果杨全基因组铵转运蛋白家族成员及其序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李磊  罗杰  李红  罗志斌 

作者单位 西北农林科技大学生命科学学院  西北农林科技大学林学院 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2011,39(2)

页码 133-142

年份 2011 

分类号 S718.43 

关键词 铵转运蛋白  杨树  基因组  序列分析 

文摘内容 【目的】探讨毛果杨(Populus trichocarpa)全基因组中铵转运蛋白(AMTs)家族成员的系统发育及部分成员的理化性质、结构和亚细胞定位?!痉椒ā恳源用钊蜃槭菘庵兴阉鞑⑸秆〉玫降哪勘甑鞍仔蛄形?应用软件CLUSTALX 2.0、GeneDOC和MEGA4,对AMTs家族成员的系统发育进行了分析,并重点分析了AMT1亚家族成员PtrAMT1-1、PtrAMT1-6和AMT2亚家族成员PtrAMT2-1、PtrAMT4-5的保守基序、理化参数、亲/疏水性、跨膜域、三级结构及亚细胞定位?!窘峁吭诿罨蜃槭菘庵蟹⑾至?9个AMTs,8个属于AMT1亚家族,11个属于AMT2亚家族;AMT1和AMT2亚家族内的蛋白序列保守性强,而亚家族之间的差异较大;AMT1与AMT2间的共同基序较少;AMTs是一类位于膜上运输NH4+的蛋白家族,有10~11个跨膜域,亚家族内蛋白三维结构相似,不同AMTs成员的亚细胞定位不同?!窘崧邸吭诿钪?AMT1与AMT2亚家族分开较早,各AMTs在杨树氮素代谢中起着不同的作用,共同维持并调控着杨树体内的氮素平衡。

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