编号 zgly0001720259

文献类型 期刊论文

文献题名 中国蜜蜂西奈湖病毒基因组测序与系统发育分析

作者 张祎  丁兆润  李文峰  韩日畴 

作者单位 广东省生物资源应用研究所广东省动物?；び胱试蠢弥氐闶笛槭夜愣∫吧锉；び肜霉彩笛槭?ensp; 华南农业大学农学院 

母体文献 应用昆虫学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S895 

关键词 西方蜜蜂  西奈湖病毒  系统发育  基因组重组分析 

文摘内容 【目的】获得广东省西方蜜蜂Apis mellifera所携带西奈湖病毒(Lake Sinai virus,LSV)基因组全长序列,并进行系统发育分析,确定其分类地位?！痉椒ā坷肧anger测序得到广东省西方蜜蜂所携带的LSV基因组全长,命名为LSV GIABR并上传至GenBank。从基因库中下载28个LSV基因组全长序列,以及34条RDRP序列,利用软件MEGA.X,分别使用最大似然法(Maximum Likelihood)和邻接法(Neighbor-Joining)构建的系统发育树,确立LSVGIABR的分类地位。另外,使用软件RDP4.0分析基因组是否发生重组及重组位置?！窘峁縇SV GIABR基因组全长5 910 nt,包含ORF1(基因组位置78-2615),RDRP(1852-3720),核衣壳蛋白Capsid(3739-5301)和ORF4(5346-5798)。全基因组和RDRP基因系统发育分析确定LSVGIABR属于LSV2,基因组重组分析推测其可能是美国和澳大利亚的LSV2株系的母本?！窘崧邸看庸愣∥鞣矫鄯浼觳獾降腖SV基因组全长为5 910 nt,属于LSV2,并可能是美国和澳大利亚的LSV2株系的母本。