编号 zgly0001686707

文献类型 期刊论文

文献题名 抽筒竹叶绿体基因组的密码子偏好性分析

作者 李江平  秦政  国春策  杨光耀  张文根 

作者单位 江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室  江西省林业科学院 

母体文献 竹子学报 

年卷期 2019年02期

年份 2019 

分类号 Q943.2 

关键词 抽筒竹  密码子偏好性  叶绿体基因组  最优密码子 

文摘内容 以抽筒竹叶绿体全基因组序列为材料进行了密码子偏好性分析,结果表明:1)抽筒竹叶绿体基因组密码子偏性较弱,有效密码子数（Effective number of codon,ENC）在38. 85～61之间,平均值为49. 66; 2)密码子第1和第3位的GC含量一定程度上有相似性,GC1和GC2、GC3呈显著相关,而第2位GC含量和其它两位差异较大; 3)密码子偏爱以A或U结尾,RSCU值大于1. 00的密码子31个,其中16个第3位碱基为U、11个以A结尾、1个以G结尾; 4) GC12与GC3相关性较弱,回归系数为0. 357 63; 5)密码子偏好性更多受到选择的影响,代表基因多数落在标准曲线的下方。