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广东割手密SSR遗传多样性分析

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编号 zgly0001433941

文献类型 期刊论文

文献题名 广东割手密SSR遗传多样性分析

作者 樊丽娜  李昱  罗青文  劳方业  王勤南  何慧怡  陈月桂  邓?;?ensp; 李奇伟  齐永文 

作者单位 广州甘蔗糖业研究所  广东省甘蔗改良与生物炼制重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2012年05期

年份 2012 

分类号 S566.1 

关键词 广东  割手密  SSR  遗传多样性 

文摘内容 割手密是甘蔗近缘野生种之一,在甘蔗育种中具有重要地位和作用。本研究采用Genomic-SSR和EST-SSR两种类型分子标记对来自广东各个地区的67个割手密种质进行分析。在20对SSR引物上共检测到341个多态性条带,每个引物上的平均多态性为17.05,其中11个Genomic-SSR的平均多态性为20.82,9个EST-SSR的平均多态性为12.44。广东割手密在Genomic-SSR上的多态性显著高于EST-SSR上的多态性。MantelTest分析表明:通过Genomic-SSR、EST-SSR以及Genomic-SSR+EST-SSR三种方法所计算的试验材料的遗传距离矩阵之间都呈极显著相关(p<0.01),说明应用两种类型SSR获得的各个材料间的遗传关系具有较高的一致性。广东割手密在20对SSR引物上的遗传多样性指数介于0.1064~0.2916之间,平均多样性指数为0.1943;各个材料间的遗传距离为0.0063~0.3082之间,平均为0.1935。UPGMA聚类分析表明:广东割手密之间的遗传关系和地理来源存在一定的相关,由南向北存在较为显著的地理分化。

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