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灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O片段的克隆与生物信息学分析

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编号 zgly0000652616

文献类型 期刊论文

文献题名 灰斑古毒蛾核型多角病毒EcoR I-O片段的克隆与生物信息学分析

学科分类 220.3020;森林昆虫学

作者 杨丽荣  闫海霞  全鑫  薛保国  达楞巴雅尔 

作者单位 河南省农业科学院植物?;ぱ芯克?ensp; 内蒙古自治区乌审旗林业局 

母体文献 华北农学报 

年卷期 2010,25(1)

页码 55-60

年份 2010 

分类号 S432.1 

关键词 灰斑古毒蛾核型多角体病毒  EcoRI-O片段  egt基因  Ol-129同源基因 

文摘内容 分析了灰斑古毒蛾核型多角体病毒(Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus,OrerNPV)EcoR I-O片段分子生物学特征,为研究egt基因分子特性和杆状病毒遗传改良提供科学依据??寺『头治隽薕rerNPVEcoR I-O片段所包含的2个基因,并应用生物软件对OrerNPV蜕皮甾体尿苷二磷酸葡糖转移酶(egt)基因及其启动子进行了比对分析。结果表明OrerNPVEcoR I-O片段包含egt基因和Ol-129同源基因,在该区域中编码egt基因的开放阅读框(ORF)由1 539个核苷酸组成,可以编码512个氨基酸,预计蛋白质分子质量为57.9 kDa。OrerNPV和NPVs之间的同源性为46%-89%,与白斑天幕毛虫核型多角体病毒(Orgyia leucostigmaNPV,OlNPV)egt基因同源性最高,达89%,与棉褐带卷叶蛾核型多角体病毒(Adoxophyes oranaNPV,AoNPV)同源性最低为46%;而OrerNPV和GVs之间的同源性为44%-55%,小于与NPVs之间的同源性;与昆虫UGT间同源性最低,与家蚕UGT间同源性为41%。EcoR I-O片段+M13端含有编码OlNPV ORF129(Ol-129)Ol-129同源基因ORF,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子ATG上游-64,-24 nt处各有1个TATA box,其推测的氨基酸序列与Ol-129同源性最高达81%,与LdNPV ORF127同源性最低,为40%。明确了OrerNPVEcoR I-O片段的序列特征,以及OrerNPVegt基因特性。

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