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肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定

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编号 zgly0001645298

文献类型 期刊论文

文献题名 肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定

作者 叶丽云  孟国良  程冰  赵丽丽  解凡  吴小平 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2018年09期

年份 2018 

分类号 S646 

关键词 野生肺形侧耳  线粒体基因组  多态性  种内鉴定 

文摘内容 线粒体是能量转化与ATP形成的重要场所,已有多种食用真菌的线粒体基因组被相继组装注释,但肺形侧耳的线粒体基因组鲜有报道。本研究对野生肺形侧耳X2菌株的线粒体基因组进行组装并注释,由野生菌株X2与主栽菌株JX线粒体大片段差异序列,构建分子标记来鉴别野生和主栽肺形侧耳菌株。结果显示X2的线粒体基因组为大小75 709bp的闭合环状结构,含有r RNA的大小亚基基因,25个负责携带氨基酸的t RNA基因以及14个常见蛋白编码基因,在cox1基因上含有9个内含子。内含子主要为IB型,包含LAGLIDADG1 superfamily、GIY-YIGCterm superfamily保守结构域。位于菌株X2与JX内含子和基因间区上的大片段差异序列,是造成种内线粒体多态性的主要因素。根据两菌株的差异片段构建系统进化树的结果显示,内含子、rnl-trn X、trn D-atp6序列能够将两株野生菌株和其他主栽菌株区分开,可用于野生肺形侧耳种内鉴定,而且trn D-atp6效果最佳。

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