编号 zgly0001354263

文献类型 期刊论文

文献题名 慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析

作者 胡尚连  曹颖  黄胜雄  孙霞  卢学琴  蒋瑶 

作者单位 西南科技大学生命科学与工程学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2009年08期

年份 2009 

分类号 S795.504 

关键词 慈竹  4CL基因  克隆  生物信息学分析 

文摘内容 【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础?！痉椒ā坎握掌渌镏?CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以这条保守区片段为模板,结合5′RACE和3′RACE克隆4CL基因全长序列,并对其进行了生物信息学分析?！窘峁砍晒寺×舜戎?CL基因全序列,该序列CDS区全长为1 674 bp,编码558个氨基酸;氨基酸序列中存在两大4CL氨基酸保守域(SSGTTGMPKGV和GEICIRG),其中前一个氨基酸保守域的第7个氨基酸位点变为M,与常见的L不同,表明慈竹的4CL基因发生了一定变异。系统进化分析表明,该基因(Na4CL)与水稻的Os4CL4和黑麦草的Lp4CL2具有很高的同源性?！窘崧邸靠寺×舜戎衲局仕睾铣擅?CL基因全长序列,在GenBank上注册为EU327341,可能与慈竹木质素生物合成有关。