编号 zgly0001690165

文献类型 期刊论文

文献题名 瓜类褪绿黄化病毒山东分离物全基因组序列扩增及分析

作者 臧连毅  孙晓辉  苏文敏  张先平  刘晓莹  竺晓平 

作者单位 山东农业大学植物?；ぱг荷蕉∈卟瞬〕嫔镅е氐闶笛槭?ensp; 上海市浦东新区高东镇城镇建设管理中心 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S432.41 

关键词 瓜类褪绿黄化病毒  全基因组  系统进化树 

文摘内容 为明确分离自山东省寿光市甜瓜上的瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)分离物的全基因组序列信息和遗传变异情况,利用毛形病毒属Crinivirus简并引物进行RTPCR检测,利用RACE技术结合RT-PCR方法克隆CCYV山东分离物2条RNA链的全基因组序列,通过与GenBank中其它地区CCYV分离物的全长序列进行比对分析其同源性,并基于CP基因序列构建系统进化树分析其遗传变异情况。结果表明,山东分离物经RT-PCR检测和测序后确定为CCYV。CCYV山东分离物与其它CCYV分离物的RNA1链和RNA2链的全基因组序列一致性的平均值分别为99.82%和99.88%,且2条链的5′末端均比较保守,没有碱基突变的情况发生;RNA1链3′末端存在2个碱基变异,RNA2链3′末端存在1个碱基变异。CCYV不同地区分离物主要分为3个簇群,其中山东分离物和中国其它地区分离物、日本分离物、苏丹分离物、黎巴嫩分离物和塞浦路斯分离物聚类在一起。研究表明CCYV基因组序列比较保守,该病毒的分化可能与地理来源存在一定的相关性。