编号 zgly0001576183

文献类型 期刊论文

文献题名 百合斑驳病毒云南分离物全基因组序列分析及CP结构预测

作者 李月月  孙健  谭冠林  马琨玲  李凡 

作者单位 云南农业大学植物?；ぱг?ensp; 星巴克咖啡种植者支持中心  云南农业大学教务处现代教育技术中心  云南大理州烟草公司大理市分公司 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2018年02期

年份 2018 

分类号 S436.8 

关键词 百合斑驳病毒  基因组  外壳蛋白  特性  结构预测 

文摘内容 对云南嵩明百合上发生的百合斑驳病毒(Lily mottle virus,LMo V)进行全基因组序列测定及分析,并对LMo V嵩明分离物(LMo V-SMi1、LMo V-SMi2)和玉溪分离物(LMo V-YXi1、LMo V-YXi2)外壳蛋白(coat protein,CP)基因进行序列比较,发现云南的LMo V分为2个类群,玉溪分离物属于种群I,嵩明分离物属于种群II。2个类群间的核苷酸和氨基酸同源性分别为86.7%～89.5%、90.1%～92.7%,玉溪分离物和嵩明分离物相比,cp基因发生了3个核苷酸的缺失。对国内外LMo V所有分离物的cp基因氨基酸序列进行系统进化分析,结果表明所有LMo V分离物可划分为2个种群,种群I分离物较种群II分离物几乎均存在1个苏氨酸缺失的差异。此外,对LMo V-SMi2的CP相关特性和空间结构进行了初步预测,认为该蛋白为球状,具有较强的表面可能性,不存在跨膜区域,大多数区域能够形成主要的抗原决定簇,主要集中在aa12-22、aa31-42、aa83-99、aa179-191、aa215-223、aa249-259区段,可作为制备抗血清选择抗原的参考。LM o V-SM i2和LM o V-YXi1在二级结构和三级结构上存在一定的差异,但总体空间结构差异不大。