编号 zgly0001693056

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉miR408b靶基因Chemocyanin的克隆及其在低温胁迫下的表达分析

作者 刘彦英  倪珊珊  项蕾蕾  孙雪丽  陈裕坤  赖钟雄 

作者单位 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S668.1 

关键词 香蕉  miR408b  Chemocyanin基因  低温胁迫  表达分析 

文摘内容 【目的】研究香蕉中miR408b及其靶基因Chemocyanin在低温胁迫下的表达模式和调控机制?！痉椒ā恳匀饕吧逗汀毂丁镀牧?利用RT-PCR和RACE技术克隆获得三明野生蕉中的MiChemocyanin基因(MiCHY)和‘天宝蕉’中的MaChemocyanin基因(MaCHY),利用在线网站对MiCHY进行生物信息学分析?！窘峁縈iCHY基因的cDNA全长为587 bp,开放阅读框381 bp,编码126个氨基酸蛋白,具有Plantacyanin结构域,属于超铜氧化还原蛋白家族。在ORF区的4～24 bp处有一处高度匹配miR408b的结合区(GCTCAGGGAAGGGGCAGTGCG)。RLM-5’RACE分析表明,miR408b主要在靶序列的第7～8个碱基之间剪切靶基因MiCHY的mRNA。序列比对发现,MaCHY基因比MiCHY基因多了82 bp的序列,符合内含子的GT-AG剪切,推测发生了内含子驻留的可变剪接。保守结构域分析表明MaCHY没有Plantacyanin结构域,但也属于铜氧化还原蛋白家族。qRT-PCR结果表明,低温胁迫下,冷敏感的‘天宝蕉’miR408b的表达量上升,MaCHY的表达量降低;在抗寒的三明野生蕉中,miR408b的表达量下降,MiCHY表达量上升,miR408b与MiCHY表达量呈负相关?！窘崧邸縨iR408b及其靶基因MiCHY可能在香蕉响应低温胁迫中发挥重要作用。