编号 zgly0001390822

文献类型 期刊论文

文献题名 紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析

作者 张文娟  李聪  王涌鑫  苗丽宏 

作者单位 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2010年02期

年份 2010 

分类号 S541.9  Q943.2 

关键词 紫花苜蓿  几丁质酶  ClassⅢ基因  生物信息学 

文摘内容 本文根据截叶苜蓿(Medicago truc atula)几丁质酶ClassⅢ基因(GenBank:AY294484.1)的全长序列设计引物,通过RT-PCR的方法得到紫花苜蓿(Medicago sative)几丁质酶ClassⅢ的核酸序列,命名为MsChiⅢ,在NCBI中的登录号为FJ872918。利用生物信息学软件分析MsChiⅢ,预测氨基酸序列的等电点、二级结构和三级结构,并构建系统发育树。结果显示该核酸序列全长为953bp,包括完整的开放阅读框,编码301个氨基酸,等电点为8.212。该序列所编码的蛋白属于几丁质酶18家族的内切酶,分布于细胞间隙,并含有几丁质酶18家族的特征序列——LGDVDFDIE,并预测MschiⅢ可能是一种具有几丁质酶和溶菌酶的双功能酶。