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利用TRAP和SCAR标记评价铁皮石斛的遗传多样性与抗寒性

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编号 zgly0001706539

文献类型 期刊论文

文献题名 利用TRAP和SCAR标记评价铁皮石斛的遗传多样性与抗寒性

作者 张君毅  吴永辉  刘嘉  秦建立  张轶钧 

作者单位 华侨大学生物工程与技术系 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S567.239 

关键词 铁皮石斛  TRAP标记  抗寒性  遗传多样性  SCAR标记 

文摘内容 开发目标区域扩增多态性(TRAP)和特异序列扩增区域(SCAR)标记,对铁皮石斛(Dendrobium officinale)的3个生态类群46份种质进行遗传多样性评价、野生群体鉴别以及抗寒性筛选。以抗寒相关的CBF1/DREB1转录因子和钙依赖型蛋白激酶(CDPK1)基因设计TRAP固定引物,从57对TRAP引物中共筛选出21个引物组合,多态信息量(PIC)、分辨率(RP)和多态带百分比(PPB)平均分别为0.899、2.054和76.79%。Nei氏基因多样度(H)为0.217 7~0.291 7 (平均为0.258 1), Shannon信息指数(I)为0.325 1~0.442 1 (平均为0.389 2)。野生类群遗传多样性水平最高,仿野生类群和栽培类群基本一致。主成分分析(PCA)结果表明供试材料可分为野生和栽培两大类群。此外,开发了一个铁皮石斛转录因子(RAP2-4)的SCAR标记,并以该SCAR标记和TRAP固定引物共同筛选出了核心抗寒种质资源。本文研究策略拟为TRAP标记在育种中的应用提供参考。

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