编号 zgly0001445623

文献类型 期刊论文

文献题名 建兰花叶病毒外壳蛋白基因和3′UTR序列测定与分析

作者 郑国华  苏勇波  郑志忠  彭德伟  明艳林 

作者单位 厦门华侨亚热带植物引种园国家农作物  国外引种隔离检疫基地  厦门市引种检疫与植物源产物重点实验室  厦门兆翔花卉科技有限公司 

母体文献 植物?；?ensp;

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S436.8 

关键词 建兰花叶病毒  外壳蛋白基因  3′非编码区  分子变异 

文摘内容 采用单链构象多态性分析从建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CyMV)的8个分离物筛选得到5个存在遗传变异的分离物,并测定了外壳蛋白(coat protein,CP)基因和3′非编码区(3′UTR)序列,经序列分析表明5个分离物与其他分离物间的CP核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87.1%～99.9%和91.1%～99.6%,属于亚组A成员。CP基因不同片段受到正选择压力的作用不一样,C端受到负选择压力的作用不易发生变异,而N端受到正选择压力的作用容易发生变异。通过RNAsharpes软件分析3′UTR序列发现各分离物均形成带有Potexvirus属保守核苷酸序列AC(C/T)TAA的三叶草茎环结构,这种结构的功能可能与病毒RNA复制有关。