编号 zgly0001643560

文献类型 期刊论文

文献题名 鳞翅目基因组IIB型内切酶位点的统计分析

作者 陈大嵩  韩诗畴  戴建青 

作者单位 广东省生物资源应用研究所广东省动物?；び胱试蠢弥氐闶笛槭夜愣∫吧锉；び肜霉彩笛槭?ensp;

母体文献 环境昆虫学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 Q963 

关键词 鳞翅目  IIB型内切酶  基因组  预测  统计 

文摘内容 IIB型限制内切酶能够识别并切割特异酶切位点两端特定距离的DNA,形成粘性末端的30 bp左右的等长DNA片段。利用其特性与限制性酶切位点关联测序技术(RAD)相结合发展出2b-RAD简化基因组测序技术,应用于遗传图谱构建、种群遗传结构分析、性状定位以及细菌分型等多种研究领域。构建2b-RAD测序文库之前,需要对基因组中的IIB型限制内切酶位点进行预测与统计分析,制定有效的测序文库构建方案。本文利用Python语言构建分析基因组中IIB型限制内切酶位点的流程,预测并统计6个鳞翅目代表物种基因组含有的8个商业化IIB型限制内切酶的酶切位点,比较了各个基因组与IIB型限制内切酶之间含有的酶切位点总量、重复序列数量以及酶切间隔长度的关系,为在昆虫基因组中进一步试行2b-RAD研究提供了参考。