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牦牛SPAG11基因克隆与生物信息学分析

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编号 zgly0001533060

文献类型 期刊论文

文献题名 牦牛SPAG11基因克隆与生物信息学分析

作者 徐绮嫔  王寒  李计尚  周金伟  张于  沈留红  余树民  彭广能  曹随忠 

作者单位 四川农业大学动物医学院奶牛疾病研究中心 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2016年12期

年份 2016 

分类号 S823.85  Q78 

关键词 牦牛  精子相关抗原11  β-防御素  生物信息学 

文摘内容 【目的】克隆牦牛(Bos grunniens)精子相关抗原11(Sperm-Associated Antigen 11,SPAG11)基因,并了解其分子结构特征,为进一步研究牦牛SPAG11生物学功能奠定基础?!痉椒ā看雨笈X和柚刑崛∽躌NA,RTPCR扩增并克隆SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E基因,测序后进行生物信息学分析?!窘峁靠寺〕鲫笈PAG11基因3个亚型:SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E,序列大小分别是351,408和261bp,分别编码117,129和80个氨基酸,其中SPAG11 D和SPAG11E序列包含1个完整开放阅读框(ORF),SPAG11C序列包含部分ORF。牦牛SPAG11C、SPAG11 D和SPAG11E核苷酸序列与黄牛(Bos taurus)相应序列相似性最高,而与黄牛β-防御素1相似性较低(<50%)。3个蛋白亚型均具有β-防御素家族基本特性,生物信息学分析显示其均含有磷酸化位点?!窘崧邸砍晒寺£笈PAG11C、SPAG11 D和SPAG11E基因,明确了其编码蛋白的分子结构特征。

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