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重伞灵芝线粒体基因组在灵芝种间鉴定中的应用

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编号 zgly0001694094

文献类型 期刊论文

文献题名 重伞灵芝线粒体基因组在灵芝种间鉴定中的应用

作者 孟国良  曾培明  王紫璎  程冰  叶丽云  吴小平 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心  福建农林大学生命科学学院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S567.31 

关键词 重伞灵芝  线粒体基因组  特异性引物  快速鉴定 

文摘内容 线粒体是动力工厂,能够进行氧化代谢实现能量的转化,参与三羧酸循环形成ATP。随着分子生物学和生物信息学技术的发展,担子菌灵芝属中已有几种灵芝的线粒体基因组被相继报道,但尚未有对重伞灵芝线粒体基因组的报道。本研究通过对重伞灵芝YX线粒体基因组进行组装注释,比较分析了与其他灵芝属物种的差异,根据差异序列构建分子标记对重伞灵芝菌株快速鉴定。结果显示重伞灵芝线粒体基因组大小为67340bp的闭合环形结构,含有15个普通蛋白编码基因,28个tRNA基因,以及rRNA的大小亚基基因。共5个基因含有12个内含子,主要为IB型,部分为ID型,包含LAGLIDADG1superfamily、GIY-YIGCterm superfamily保守结构域。根据重伞灵芝线粒体cox2基因设计的特异性引物扩增结果显示:4株重伞灵芝的cox2基因片段均可准确扩增,且扩增不出其他灵芝物种的cox2基因片段。基于各灵芝菌株线粒体cox2基因序列构建系统进化树,可以将4株重伞灵芝归在同一分支上,并且同源性为98%,与ITS鉴定结果一致。可见,基于线粒体基因cox2特异性引物可以快速地对重伞灵芝进行鉴定,且只需通过观察扩增条带的有无,无需测序,省时省力。

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