编号 zgly0001643824

文献类型 期刊论文

文献题名 基于银杏花芽3个分化时期转录组测序的相关基因筛选与表达分析

作者 何崇单  蔡雨蒙  李萌  董金金  刘伟  王俊燚  王义强 

作者单位 中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室  中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年08期

年份 2018 

分类号 S792.95 

关键词 银杏  转录组测序  开花调控  GI  FT/TFL1  SOC1 

文摘内容 鉴定银杏花芽分化调控的关键基因,揭示银杏花芽分化调控的主要分子机制,为缩短银杏童期和选育银杏早花品种提供理论指导。本研究中采用高通量测序技术对银杏花芽分化3个时期（花芽未分化期、花芽分化始期、花芽分化盛期）的样品进行转录组测序,并分析数字表达谱,筛选开花调控相关基因并进行荧光定量PCR（RT-qPCR）表达验证。转录组测序共产生27.52 Gb原始数据,注释到8大功能数据库（GO、COG、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot、egg NOG）上的unigene总数为35 179个。通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,将unigene分别归于55个GO类别和126个代谢途径。差异表达基因分析显示,花芽未分化期较花芽分化始期有2 253个基因上调,2 032个基因下调;花芽分化始期较花芽分化盛期有1 770个基因上调,1 901个基因下调;花芽未分化期较花芽分化盛期有1 865个基因上调,2 042个基因下调。发掘出大量的开花相关的基因涉及5个开花调控途径（光周期途径、春化途径、赤霉素途径、自主途径和年龄途径）。筛选出gene.Gb17618（GI序列）、gene.Gb19790（FT/TFL1序列）、gene.Gb16301（AG序列）、gene.Gb28337（花发育MADS-box序列）、gene.Gb01884（SOC1序列）和gene.Gb41704（CO序列）等6个银杏花芽分化差异表达关键基因序列,荧光定量PCR检测表达水平与转录组结果一致。