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数据资源: 中文期刊论文

8种植物CHI基因的生物信息学分析

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编号 zgly0001438342

文献类型 期刊论文

文献题名 8种植物CHI基因的生物信息学分析

作者 原晓龙  周军  辛培尧  董娇  孟富宣  付?;?ensp;

作者单位 西南林业大学林学院  西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室  中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所  复旦大学生命科学学院 

母体文献 西南林业大学学报 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 Q943 

关键词 查尔酮异构酶  生物信息学分析  蛋白质功能预测 

文摘内容 根据GenBank上已登录的拟南芥、苹果杂交种、草莓、桃、沙梨的栽培种美人酥、葡萄、柑橘和玉米的查尔酮异构酶基因蛋白质氨基酸残基序列,应用生物软件对其组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性与亲水性、蛋白质二级和三级结构以及功能域进行预测和分析。结果表明:8种植物的CHI不具有导肽,不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测CHI可能定位于细胞质基质中发挥功能,多肽链总体表现为亲水性;有α-螺旋、β-转折、无规则卷曲和延伸链4种二级结构,除了无规则卷曲是桃的最主要二级元件外;其余7种植物均是α-螺旋为最主要的结构元件;8种植物可能均有1个查尔酮异构酶活性部位。

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