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金针菇HMG-box转录因子鉴定及一个候选基因的差异表达分析

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编号 zgly0001577763

文献类型 期刊论文

文献题名 金针菇HMG-box转录因子鉴定及一个候选基因的差异表达分析

作者 孟丽  王丽  刘芳  丑天胜  王威  谢宝贵 

作者单位 山东农业大学植物?;ぱг荷蕉∨┮滴⑸镏氐闶笛槭?ensp; 福建农林大学菌物研究中心 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S646.15 

关键词 金针菇  原基形成  高速泳动蛋白  转录因子 

文摘内容 食用菌的原基形成受到环境因子和内源基因的共同调控,转录因子在其生长发育过程中能够起到关键作用。本研究在已测序金针菇单核菌株L11全基因组中鉴定到29个高速泳动蛋白(high-mobility-group box,HMG-box)转录因子编码基因?;诮鹫牍剿司闔1123各发育时期转录组数据,筛选到一个与金针菇原基形成相关的HMG-box转录因子基因Fv-hmg。通过同源比对发现Fv-hmg的DNA序列在6个不同金针菇菌株中十分保守,一致性为98.38%,有92个SNP位点。克隆分析表明,该基因长度为1 517bp,含有一个内含子。该基因编码489个氨基酸残基的蛋白序列,含有一个HMG-box结构域。通过实时荧光定量PCR和转录组测序共同分析表明,该基因在金针菇原基时期的表达量比双核菌丝时期高达4倍以上,具有显著性差异(P<0.01),由此推测该转录因子参与调控金针菇的原基形成。HMG-box转录因子Fv-Hmg在金针菇原基形成过程中的作用仍需进一步研究。

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