编号
zgly0001393210
文献类型
期刊论文
文献题名
小麦过敏性诱导反应基因TaHIR4的克隆及序列分析
作者
张岗
孙燕飞
李依民
董艳玲
夏宁
王晓杰
黄丽丽
康振生
作者单位
西北农林科技大学植物?;ぱг?ensp;
陕西省农业分子生物学重点实验室
母体文献
西北农林科技大学学报(自然科学版
年卷期
2010年08期
年份
2010
分类号
S435.12
关键词
小麦
条锈菌
过敏性反应
电子克隆
结构域
文摘内容
【目的】克隆条锈菌诱导的小麦过敏性反应(Hypersensitive induced reaction,HIR)基因TaHIR4,分析其编码蛋白的结构、进化与功能?!痉椒ā坎捎玫缱涌寺?、RT-PCR技术,从条锈菌侵染的小麦中,分离过敏性诱导基因TaHIR4,并对其进行克隆和序列分析;利用InterProScan、TMpred、SignalP 3.0、PSORT等在线分析工具,预测TaHIR4蛋白的保守结构域、跨膜结构、信号肽、细胞定位等特征;采用DNASTAR软件分别进行氨基酸序列同源性比对和进化树分析?!窘峁糠掷氲叫÷蠊粜杂盏蓟?命名为TaHIR4(867bp,GenBank注册号为FJ028663),该基因编码1条由288个氨基酸组成的多肽;TaHIR4蛋白含HIR蛋白家族的保守SPFH(Stomatins,Prohibitin,Flotillins,HflK/C)、PHB(Prohibitin homologues)结构域,有4种典型的motifs(蛋白激酶、酪蛋白激酶Ⅱ、酪氨酸激酶磷酸化和N-豆蔻?;坏?,N末端的19个氨基酸序列内部存在跨膜信号肽结构,可能属于分泌蛋白;TaHIR4与HvHIR4蛋白的亲缘关系最近,同源性最高(98%),其次为OsHIR4,同源性为91%?!窘崧邸糠掷氲?个条锈菌诱导的小麦HIR基因TaHIR4,其编码蛋白可能属于分泌蛋白,在胞外行使功能。