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小麦过敏性诱导反应基因TaHIR4的克隆及序列分析

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编号 zgly0001393210

文献类型 期刊论文

文献题名 小麦过敏性诱导反应基因TaHIR4的克隆及序列分析

作者 张岗  孙燕飞  李依民  董艳玲  夏宁  王晓杰  黄丽丽  康振生 

作者单位 西北农林科技大学植物?;ぱг?ensp; 陕西省农业分子生物学重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2010年08期

年份 2010 

分类号 S435.12 

关键词 小麦  条锈菌  过敏性反应  电子克隆  结构域 

文摘内容 【目的】克隆条锈菌诱导的小麦过敏性反应(Hypersensitive induced reaction,HIR)基因TaHIR4,分析其编码蛋白的结构、进化与功能?!痉椒ā坎捎玫缱涌寺?、RT-PCR技术,从条锈菌侵染的小麦中,分离过敏性诱导基因TaHIR4,并对其进行克隆和序列分析;利用InterProScan、TMpred、SignalP 3.0、PSORT等在线分析工具,预测TaHIR4蛋白的保守结构域、跨膜结构、信号肽、细胞定位等特征;采用DNASTAR软件分别进行氨基酸序列同源性比对和进化树分析?!窘峁糠掷氲叫÷蠊粜杂盏蓟?命名为TaHIR4(867bp,GenBank注册号为FJ028663),该基因编码1条由288个氨基酸组成的多肽;TaHIR4蛋白含HIR蛋白家族的保守SPFH(Stomatins,Prohibitin,Flotillins,HflK/C)、PHB(Prohibitin homologues)结构域,有4种典型的motifs(蛋白激酶、酪蛋白激酶Ⅱ、酪氨酸激酶磷酸化和N-豆蔻?;坏?,N末端的19个氨基酸序列内部存在跨膜信号肽结构,可能属于分泌蛋白;TaHIR4与HvHIR4蛋白的亲缘关系最近,同源性最高(98%),其次为OsHIR4,同源性为91%?!窘崧邸糠掷氲?个条锈菌诱导的小麦HIR基因TaHIR4,其编码蛋白可能属于分泌蛋白,在胞外行使功能。

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