编号 zgly0001338112

文献类型 期刊论文

文献题名 萝卜中一种新dsRNA的全长cDNA克隆及序列分析

作者 李露露  李力强  乔爱民  陈亮  陈集双 

作者单位 浙江理工大学生物工程研究所  仲恺农业技术学院农业与园林学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2008年08期

年份 2008 

分类号 S631.1 

关键词 萝卜  双链RNA  双分病毒科  Raphanus sativus virus 1 

文摘内容 从‘一点红’萝卜(Raphanus sativus-root‘Yidianhong’)叶片中提取dsRNA,应用SPAT方法对各dsRNA条带进行cDNA克隆并测序,除获得先前报道的5条序列(RasR1~Ras R5)以外,还得到一条新的全长序列,将其定名为RasR6(EU285027)。序列分析结果表明:RasR6全长为1778bp,其正义链编码1个由502个氨基酸组成、分子量约为55.1kD的蛋白质。该序列与前人报道的双分病毒科5个病毒序列具有相似性,且它们均编码双分病毒科病毒的外壳蛋白(capsid protein,CP)。核苷酸序列比对结果显示:RasR6与同时来源于萝卜的RasR1和RasR2的5′UTR序列高度同源,且其3′末端具有poly A结构,而与RasR3、RasR4和RasR5的UTR则没有明显的相似性。因此,推测RasR6与RasR1、RasR2同属于双分病毒RasV1(Raphanus sativus virus 1),可能与RasR2共同编码该病毒的CP或作为RasV1的卫星RNA存在。