编号 zgly0001531432

文献类型 期刊论文

文献题名 仁用杏花芽3个发育时期转录组表达谱研究

作者 宋猜  姜仲茂  李慧  乌云塔娜 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S662.2 

关键词 仁用杏  花期  转录组分析  数字基因表达谱  开花途径 

文摘内容 为给仁用杏分子育种提供理论依据,培育仁用杏晚花新品种,通过Illumina Hi SeqTM2000高通量测序——转录组测序(RNA-seq)技术,对采于花芽萌动前后3个发育时期的仁用杏花芽进行转录组测序。经组装分析获得43 469条unigenes;将所得到的unigenes与基因库数据进行比较,对unigenes进行功能注释,共22 874条unigenes获得功能注释,并预测出21 910条unigenes蛋白编码区;将3个发育时期仁用杏花芽的花转录组通过GO功能分类,将17 237条unigenes分别归类为46个GO Term;通过将所有unigenes与KOG数据库比对,共有8 379条unigenes与其它植物相似,归为26类,未知功能的unigenes有409条,预测这些基因为仁用杏的新基因;通过与KEGG数据库比对,共获得6 203条unigenes,参与259个代谢途径,其中与植物节律代谢通路相关的unigenes有33条。