编号 zgly0001559198

文献类型 期刊论文

文献题名 林麝肺炎克雷伯氏菌的分离鉴定及其kp05372基因的生物信息学分析

作者 赵位  王吴优  程建国  田青  罗燕 

作者单位 四川农业大学动物医学院  四川养麝研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年12期

年份 2017 

分类号 S852.61 

关键词 林麝  肺炎克雷伯氏菌  kp05372  生物信息学分析 

文摘内容 【目的】对1株疑似肺炎克雷伯氏菌进行分离鉴定及全基因测序分析,并对发现的新基因kp05372编码产物进行生物信息学分析。【方法】采用传统的细菌鉴定方法和分子生物学方法,分别对采自麝粪便的1株病原菌的生理生化特征及16SrRNA序列进行测定;以小鼠感染试验和半数致死量(LD50)测试该病原菌的致病性;用全基因组测序方法对病原菌基因组进行测序分析,并对发现的新基因编码产物进行生物信息学分析?！窘峁烤砩匝楹?6SrRNA序列分析发现,分离菌株为肺炎克雷伯氏菌,命名为GPKP,其对小鼠致死的LD50为6.3×107CFU/mL。该菌基因组大小为4 879 707bp,包含5 490个开放阅读框,共注释到22组COG功能。kp05372基因编码产物由302个氨基酸组成,无信号肽,是一种不稳定的、在细胞内发挥生理作用的亲水性蛋白。【结论】分离的细菌为肺炎克雷伯氏菌,kp05372基因编码产物属于典型的LysR家族转录因子(LTTR)。