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海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体遗传结构分析

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编号 zgly0001638804

文献类型 期刊论文

文献题名 海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体遗传结构分析

作者 曹学仁  车海彦  罗大全 

作者单位 中国热带农业科学院环境与植物?;ぱ芯克┮挡咳却魑镉泻ι镒酆现卫碇氐闶笛槭?ensp;

母体文献 植物?;?ensp;

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S763.7 

关键词 橡胶树炭疽病  暹罗刺盘孢菌  ITS序列  群体遗传结构 

文摘内容 暹罗刺盘孢菌Colletotrichum siamense是引起海南橡胶树炭疽病的重要病原之一,为了明确海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体的遗传结构,本研究对海南5个市(县)的橡胶树暹罗刺盘孢菌的ITS序列进行分析。结果表明,58个病菌样品可推导出11种单倍型,其中单倍型H11包含样品数最多且在5个市(县)均有分布,其次为单倍型H4,在4个市(县)有分布。遗传分化指数(Fst)表明保亭种群与其他种群的遗传分化较大。AMOVA分析显示,遗传变异主要发生在种群内,占总变异的93.9%。对所有地理种群病原菌ITS序列的核苷酸不配对进行分析,表明病菌未经历过大规模的种群扩张。系统发育分析表明,来自相同地区的病菌单倍型并没有聚在一起。研究结果表明海南橡胶树暹罗刺盘孢菌种群具有丰富的遗传多样性。

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