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桑树桑黄菌丝体和子实体基因差异表达分析

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编号 zgly0001721125

文献类型 期刊论文

文献题名 桑树?;凭刻搴妥邮堤寤虿钜毂泶锓治?

作者 王伟科  宋吉玲  闫静  陆娜  袁卫东  周祖法 

作者单位 杭州市农业科学研究院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2020年10期

年份 2020 

分类号 S567.3 

关键词 ?;?ensp; 菌丝体  子实体  差异表达基因 

文摘内容 通过对桑树桑黄Sanghuangporus sanghuang菌丝体和子实体2个不同生长阶段的转录组进行分析,为研究?;谱邮堤迳し⒂喙鼗频於ɑ?。采用Illumina测序技术,对桑树?;凭闟23菌丝体和子实体2个不同生长发育阶段进行了全转录组测序。将转录组测序reads比对到参考序列上,菌丝体测序样本的reads比对率为82.89%;子实体测序样本的reads比对率为83%?;虿钜毂泶锓治鱿允?与菌丝体相比,子实体中显著上调表达基因为2 898个,显著下调表达基因为1 965个。经过Blast nr比对发现,?;凭谧邮堤褰锥伪泶锪可仙幕蛑饕敫髦盅趸富钚浴⑹杷鞍椎认喙?表达量下降的基因主要与糖类、氨基酸结合、运输等相关?;虮咎?gene ontology,GO)富集分析表明,菌丝体及子实体两个阶段与跨膜转运相关的差异表达基因富集明显。代谢通路(pathway)富集分析表明,类固醇生物合成、精氨酸生物合成、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路等差异基因富集明显。

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