编号 zgly0001420082

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析

作者 刘峰  王运生  田雪亮  茆振川  邹学校  谢丙炎 

作者单位 湖南省农业科学院蔬菜研究所  中国农业科学院蔬菜花卉研究所  湖南农业大学生物安全科学技术学院  河南科技学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  转录组  EST-SSR 

文摘内容 利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221037条unigenes(97.3Mb)中筛选得到17319个SSR位点(7.83%),其发生频率为1/56kb。其中以单核苷重复基序为主导类型,占总SSR的56.30%;其次是二、三核苷酸重复基序,其出现频率分别为19.16%和23.18%。对所有含SSR位点EST序列设计的10468对引物进行E-PCR多态性检测,获得1538对E-PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证,其中7对(36.84%)在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性,PIC值范围为0.33～0.89,平均为0.67,将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开发为辣椒遗传多样性分析、图谱构建提供了更丰富的候选分子标记。