编号 zgly0001542510

文献类型 期刊论文

文献题名 柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法

作者 傅建敏  索玉静  刘慧敏  谭晓风 

作者单位 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室  国家林业局泡桐研究开发中心  中国林业科学研究院经济林研究开发中心 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 Q943.2 

关键词 柿属植物  叶绿体  密码子偏好性  最优密码子 

文摘内容 为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密码子数在49.58~50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36~59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾。