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毛白杨不同组织器官稳定表达看家基因的筛选

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编号 zgly0001530999

文献类型 期刊论文

文献题名 毛白杨不同组织器官稳定表达看家基因的筛选

作者 王瑛  陈亚娟  丁莉萍  魏建华  王宏芝 

作者单位 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心  首都师范大学 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2016年08期

年份 2016 

分类号 S792.117 

关键词 实时荧光定量PCR  内参基因  基因表达水平  毛白杨 

文摘内容 以毛白杨(Populus tomentosa)‘BJHR01’的不同组织器官为材料,运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术及内参基因表达稳定性分析软件Best Keeper、Norm Finder和geNorm分析了8个看家基因在毛白杨不同组织器官中的表达稳定性。所选看家基因包括细胞骨架蛋白肌动蛋白基因(actin)、微管蛋白基因(TUB)、18S核糖体RNA基因(18S rRNA)、翻译延伸因子(EF-1 beta)、翻译起始因子(eIF 5AV)、组蛋白编码基因(H3)、核糖体蛋白基因(RP)和泛素蛋白基因(UBQ),结果发现eIF 5AV、actin和UBQ三个内参基因在毛白杨不同组织器官中表达水平稳定,适合在定量PCR分析中作为内参基因;TUB的表达稳定性最差,不适宜作为毛白杨不同组织器官基因表达研究的内参基因。在毛白杨不同组织器官基因表达水平研究中,可选用eIF 5AV、actin和UBQ三个内参基因的几何平均数作为参照标准,实验数据的分析将更为准确。

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