编号 zgly0001691258

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲脂氧合酶基因家族全基因组鉴定及其表达特性研究

作者 朱利利  庆军  杜庆鑫  何凤  杜红岩 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心  国家林业局杜仲工程技术研究中心 

母体文献 植物研究 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 Q943.2  S567.19 

关键词 杜仲  LOX基因家族  生物信息学  基因功能 

文摘内容 LOX(脂氧合酶)是动、植物中普遍存在的一种氧合酶,在植物的生长发育和逆境胁迫中发挥重要作用。本研究在杜仲基因组范围内,利用生物信息学方法对LOX基因家族进行全面鉴定,并分析了其基因结构、定位及其所编码蛋白质的理化性质、结构特征、分类和功能等。结果显示:杜仲LOX基因家族有23条LOX基因序列,分别定位于细胞质或叶绿体中,分为9-LOX和13-LOX两个亚家族,其中9-LOX类型仅包含一个,13-LOX类型包含22个; 23个LOX基因非平均分布于12条scaffolds上,一些基因发生串联分布; RNA-Seq表达结果显示6个13-LOX类型基因在杜仲叶、果、树皮和种仁中几乎没有表达,而其他17个LOX基因表达具有组织和时空表达特异性。研究结果为揭示杜仲LOX基因家族成员的功能提供重要线索,为进一步研究LOX基因家族提供理论基础。