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SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征

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编号 zgly0001479314

文献类型 期刊论文

文献题名 SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征

作者 周雁  范秀芝  陈连福  边银丙 

作者单位 华中农业大学应用真菌研究所 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2014年02期

年份 2014 

分类号 S646.6 

关键词 黑木耳  毛木耳  转录组  简单重复序列  基序 

文摘内容 以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSR Locator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰度和密度较黑木耳小。在两者的SSR中,三碱基和六碱基重复的出现最多。对含量最多的三碱基重复序列的基序进行分析表明富含GC的SSR在这两个种的转录组中占优势地位。

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