编号 zgly0001525344

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果全基因组多聚半乳糖醛酸酶基因家族的鉴定及进化分析

作者 陈鸿飞  邵红霞  樊胜  马娟娟  张东  韩明玉 

作者单位 西北农林科技大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2016年10期

年份 2016 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  PG  家族分析  生物信息学 

文摘内容 从苹果全基因组中鉴定出85个多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因,通过聚类分析将其分成了7个组(Group A~Group G),其分子量在176~1 125 aa之间,等电点在4.68~9.58之间。鉴定出来的Md PG基因除在14号染色体没有分布外,其余都有分布。系统分析了Md PG蛋白的保守基序和Md PG基因结构,发现苹果PG蛋白除包含有广泛存在于各种PG蛋白的4个保守基序以外,还含有其他相对特异的保守基序,Md PG75具有最多的外显子数,达到18个。对85个苹果PG蛋白之间的功能联系网络进行了系统研究,分析预测了相关基因的功能和多个基因间功能的联系,并作了初步验证。