编号 zgly0001561742

文献类型 期刊论文

文献题名 东北林蛙PDK1基因的克隆及生物信息学分析

作者 巩珊珊  邵婕  曲俐俐  柴龙会  张晶钰  肖向红 

作者单位 东北林业大学野生动物资源学院 

母体文献 野生动物学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 Q953 

关键词 东北林蛙  PDK1基因  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 PDK1是PI3K/Akt信号通路中的一个重要的激酶。在哺乳动物中,PI3K/Akt信号通路是一条保守的通路,通过激活下游的因子对糖代谢、脂肪代谢以及蛋白质代谢,细胞的增殖、分化、凋亡等起调节控制作用。本研究基于东北林蛙转录组数据,从中鉴定出PDK1基因3条Unigene序列,并通过RACE法克隆了PDK1基因的全长cDNA,命名为rdPDK1,其全长为1 990 bp,开放阅读框长1 674 bp,编码557个氨基酸。进行生物信息学分析,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量63.7 kD,等电点为7.21。该蛋白第82~344个和443~549个氨基酸是2段保守结构域STKc激酶域和PH调节结构域。同源性分析表明rdPDK1蛋白与HsPDK1蛋白氨基酸序列一致率为79%,相似率为100%;与MmPDK1蛋白氨基酸序列一致率为80%,相似率为100%。本研究结果有望为进一步研究东北林蛙PI3K/Akt信号通路中PDK1基因的特性及功能奠定基础。