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蝴蝶兰EST资源的SSR信息分析

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编号 zgly0000650059

文献类型 期刊论文

文献题名 蝴蝶兰EST资源的SSR信息分析

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 李冬梅  吕复兵  朱根发  洪彦彬  陈小平  染炫强  操君喜  孙映波 

作者单位 广东省农科院花卉研究所/广省园林花卉种质创新综合利用重点实验室  广东省农科院作物研究所 

母体文献 广东农业科学 

年卷期 2011,38(3)

页码 117-120

年份 2011 

分类号 S682.31 

关键词 蝴蝶兰  EST  SSR信息 

文摘内容 对5 472条蝴蝶兰无冗余EST序列进行了SSR搜索,共检索出376条EST含有419个SSR位点,平均每7.4 kb EST序列出现1个SSR。共有60种SSR的重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占SSR总数的67.1%和30.3%;AG/CT在SSR基元中出现频率最高(46.1%),AT/AT次之(18.6%)。根据搜索结果设计了100对蝴蝶兰EST-SSR引物,并随机合成了20对引物。以2个蝴蝶兰品种的DNA为模板,对引物进行了筛选和评价,有16对引物扩增出稳定且清晰的目标产物,其中12对引物扩增的产物存在多态性。

相关图谱

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