编号
zgly0000650059
文献类型
期刊论文
文献题名
蝴蝶兰EST资源的SSR信息分析
学科分类
220.1070;森林植物学
作者
李冬梅
吕复兵
朱根发
洪彦彬
陈小平
染炫强
操君喜
孙映波
作者单位
广东省农科院花卉研究所/广省园林花卉种质创新综合利用重点实验室
广东省农科院作物研究所
母体文献
广东农业科学
年卷期
2011,38(3)
页码
117-120
年份
2011
分类号
S682.31
关键词
蝴蝶兰
EST
SSR信息
文摘内容
对5 472条蝴蝶兰无冗余EST序列进行了SSR搜索,共检索出376条EST含有419个SSR位点,平均每7.4 kb EST序列出现1个SSR。共有60种SSR的重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占SSR总数的67.1%和30.3%;AG/CT在SSR基元中出现频率最高(46.1%),AT/AT次之(18.6%)。根据搜索结果设计了100对蝴蝶兰EST-SSR引物,并随机合成了20对引物。以2个蝴蝶兰品种的DNA为模板,对引物进行了筛选和评价,有16对引物扩增出稳定且清晰的目标产物,其中12对引物扩增的产物存在多态性。