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花椒茎尖节点转录组测序及基因注释

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编号 zgly0000890047

文献类型 期刊论文

文献题名 花椒茎尖节点转录组测序及基因注释

学科分类 220.45;经济林学

作者 蒋弘刚  魏安智  杨途熙  代惠萍 

作者单位 西北农林科技大学林学院  陕西理工学院 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2014(6)

页码 94-99

年份 2014 

关键词 花椒  皮刺分化  转录组  高通量测序 

文摘内容 花椒茎枝有尖锐皮刺,在实际生产中增加采摘成本,并降低采摘效率。为培育品质优良的无刺品种,筛选皮刺分化的关键基因具有重要意义。使用二代高通量测序技术对花椒皮刺起始分化的茎尖节点组织转录组进行测序,使用生物学软件对原始数据进行拼装,最终获得45 057条转录本序列。使用比对工具将得到的转录本与Swiss-Prot,NR,Pfam,KEGG,KOG数据库比对后,80.34%的转录本序列至少被一个数据库注释?;袢〉拇罅康幕蛐蛄屑白⑹托畔⑽徊教骄炕ń菲ご谭只肿踊硖峁┝肆己玫幕?为定位皮刺分化关键基因提供依据。

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