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梅花鹿鹿茸组织PDGFA基因cDNA克隆及序列分析

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编号 zgly0001557947

文献类型 期刊论文

文献题名 梅花鹿鹿茸组织PDGFA基因cDNA克隆及序列分析

作者 梁运涛  卢斌山  张强  高悦禹  夏彦玲 

作者单位 东北林业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2017年11期

年份 2017 

分类号 S825 

关键词 梅花鹿  PDGFA基因  克隆  序列分析  进化分析 

文摘内容 为了探讨PDGFA基因的结构和功能,采用RT-PCR方法获得梅花鹿PDGFA基因,并运用生物信息学软件对其序列进行了分析。结果表明:梅花鹿PDGFA基因开放阅读框大小为591 bp,共编码196个氨基酸,蛋白的分子质量约为22 ku,理论等电点(pI)为8.53,是亲水性蛋白,具有信号肽。二级结构分析显示,含有47.45%无规则卷曲、39.29%α-螺旋、13.27%扩展链。进化分析显示,PDGFA蛋白与白尾鹿(Odocoileus virginianus texanus)、家牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)、野猪(Sus scrofa)、白犀牛(Ceratotherium simum)、小鼠(Mus musculus)、密西西比鳄(Alligator mississippiensis)、原鸡(Gallus gallus)、绒啄木鸟(Picoides pubescens)的蛋白质序列相似度分别为98%、97%、96%、94%、93%、89%、81%、79%、78%。

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